Parece que pudo haber sido insinuado en uno de los flashbacks (hubo algunos de ellos en el último episodio) y siempre pareció que tenía algo que ver con ese árbol que Binchou-tan siempre está mirando (y escribe un carta al final).
¿Murió su abuela en el árbol? ¿Murió de vejez o fue repentino (como ser atacada por un lobo)? Parece extraño que abandonara a Binchou-tan en medio del bosque si supiera que se estaba muriendo.
Esto se explica en el último (cuarto) volumen del manga:
Se derrumbó y falleció en un mercado cuando fue a un pueblo.
La página respectiva:
Imagen tomada de livedoor, un blog japonés
Traducción:
2do - 4to panel: Buenas tardes. Eres Binchou-tan, ¿verdad? Soy un portavoz del ayuntamiento ... su abuela falleció en el pueblo. Ayer en el mercado se derrumbó y ...